Sekvenciranje bakterijskih genomov za preverjanje prenosa iz živali na človeka

(30.12.2013) Raziskovalci so sekvencirali celotne genome za ugotovitev, ali se rezistentne bakterije prenašajo iz živai na ljudi na primeu dveh bolezenskih izbruhov na različnih farmah na Danskem.

Rezultati letošnje študije so bili obljavljeni v reviji EMBO Molecular Medicine in potrjujejo prenos meticilin rezistentne Staphylococcus aureus (MRSA) iz živali na človeka. MRSA je bakterijski bolezenski povzročitelj, ki nosi pred kratkim opisan gen mecC. Omenjeni gen je odgovoren za rezistenco na penicilinu podoben antibiotik meticilin.

Infekcije z rezistentnimi bakterijami predstavlajo velik izziv za javno zdravstvo in lahko imajo hude, včasih celo smrtne posledice. Ker cena metod za sekvenciranje celtnih genomov upada, ob tem pa se hitrost preiskav povečuje, je za znanstvenike zmeraj bolj zanimiva sekvenca genomov za razvozlavanje vprašanj povezanih z boleznimi.

„Uporabili smo celotno genomsko sekvenciranje da bi ugotovili, ali sta oba izbruha bolezni bila povzročena z enako bakterijo ter da smo raziskali ali so se patogeni prenašali z živali na človeka ali obratno,“ komentira Mark Holmes z Univerze v Cambridgeu in glavni avtor članka. „Na prvi pogled je bilo smiselno pričakovati, da je izbruh bolezni na geografsko bližnjih lokacijah povzročil enak patogen. Po natančejšem pregledu posameznih razlik v nukleotidih DNK sekvenc vsakega izolata pa je postalo jasno, da sta za dva različna izbruha bila odgovorna dva različna seva bakterije. V enem od primerov so rezultati tudi jasno pokazali, da je najverjetnejša smer prenosa potekala iz živali na človeka.“

Meticilin rezistentna S. Aureus lahko povzroča izčrpavajoče infekcije kože in mehkih tkiv, bakteremije, pneumonije in endokarditise. Raziskovalci so uporabili sistem Illumina HiSeq za natančnejši vpogled v nukleotidno zaporedje vsakega patogena. Na podlagi primerjav posameznih razlik v nukleotidih vsake sekvence so lahko prišli do zaključkov o identiteti obeh patogenov in o poteh prenosa.

Raziskovalci poudarjajo, da sekvenciranje celotnih genomov ne more zamenjati tradicionalnih načinov analize bolezni, kljub temu pa lahko občutno poveča zmožnosti za razlikovanje med posameznimi patogeni, ki nastopajo kot povzročitelji bolezni.

„Naše ugotovitve kažejo na sposobnost MRSA sevov, ki smo jih študirali, za prenos med živalmi in ljudmi, kar ponovno usmerja žaromet na vlogo živinoreje kot potencialni rezervoar za antibiotično rezistentne bakterije,“ poudarja Ewan Harrison, eden izmed poglavitnih avtorjev prispevka.

Izvirni članek: Whole genome sequencing identifies zoonotic transmission of MRSA isolates with the novel mecA homologue mecC

Ewan M. Harrison, Gavin K. Paterson, Matthew T.G. Holden, Jesper Larsen, Marc Stegger, Anders Rhod Larsen, Andreas Petersen, Robert L. Skov, Judit Marta Christensen, Anne Bak Zeuthen, Ole Heltberg, Simon R. Harris, Ruth N. Zadoks, Julian Parkhill, Sharon J. Peacock, Mark A. Holmes

Prispevek v celoti lahko preberete na povezavi http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/emmm.201202413/full

Sorodni članki

Študija Univerze v Hohenheimu: vedenje o povezavi med mlekom in rojstvom telet je med prebivalci šibko; Vir slike: Universität Hohenheim/Angelika Emmerling

Študija Univerze v Hohenheimu: vedenje o povezavi med mlekom in rojstvom telet je med prebivalci šibko

Po ugotovitvah Univerze Hohenheim v Stuttgartu so prenos znanja, spodbujanje povpraševanja in politična podpora le nekateri pristopi k reševanju tako imenovanega “problema teleta”
preberi več

EFSA

Bolezen modrikastega jezika: EFSA ocenjuje ukrepe za zatiranje

Programi masovnega cepljenja v obdobju vsaj 5 let, skupaj z izboljšanjem sistemov za kontinuiran nadzor, so edini učinkoviti ukrepi za izkoreninjanje bolezni modrikastega jezika v Evropi, zaključuje EFSA
preberi več

TiHo

Sezona žara: raziskava kaže na povezavo med otoplitvami in želodčno-črevesnimi obolenji

Ko se pomladni pričnejo višati temperature, se zveča tudi pojavnost želodčno-črevesnih težav. Povezava je bila tudi strokovno dokazana v raziskavi
preberi več

‚Bio‘ še zmeraj narašča

‚Bio‘ še zmeraj narašča

Nedavna študija glede bio površin in živilske industrije kaže kontinuirano pozitven razvoj na svetovni ravni
preberi več

EFSA

Izbruh okužbe s Salmonelo v evropskem prostoru

Sedem držav je med 1. majem in 12. oktobrom 2016 sporočilo primere okužbe s povzročiteljem Salmonella Enteritidis pri ljudeh. Od teh je 112 primerov bilo potrjenih in pri 148 postavljen sum.
preberi več

EFSA

Vozličasti dermatitis – cepljenje je najučinkovitejša metoda za nadzor bolezni

Cepljenje govedi je najučinkovitejša metoda za nadzor in zaustavitev širjenja bolezni vozličastega dermatitisa, trdijo strokovnjaki EFSA
preberi več

Universität Duisburg-Essen

Prašiči s prirojenim kompasom

Nedavna mednarodna raziskava, ki jo je vodil zoolog dr. E. Pascal Malkemper je pokazala, da imajo divji prašiči očitno smisel za magnetno polje
preberi več

EMA

EMA priporoča zmanjšanje uporabe kolistina pri živalih

Evropska agencija za zdravila (EMA - European Medicines Agency) je posodobila v letu 2013 izdana strokovna priporočila glede uporabe antibiotika kolistina pri živalih
preberi več